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| 1º ano › 1º semestre | a.c. | créditos ects |
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| Opção I | | 6 |
Qualquer unidade curricular de 2º ciclo da área científica da Química ou da Bioquímica ou da Biotecnologia.
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| Bioquímica Aplicada | BQ | 6 |
| Prática de Investigação e Metodologia Científica | BQ | 6 |
| › percurso: Bioquímica Alimentar |
| Compostos Bioativos e Alimentos Funcionais | BQ | 6 |
| Bioquímica e Química dos Alimentos | BQ | 6 |
| › percurso: Bioquímica Clínica |
| Farmacologia Molecular | CBM | 6 |
| Patologia Clínica I | CBM | 6 |
| › percurso: Métodos Biomoleculares |
| Proteómica e Metabolómica | BQ | 6 |
| Laboratórios de Bioquímica I | BQ | 6 |
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| 1º ano › 2º semestre | a.c. | créditos ects |
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| Opção II | | 6 |
| Bioempreendedorismo | GES | 6 |
Qualquer unidade curricular de 2º ciclo da área científica da Biologia ou da Bioquímica, com a exceção da Unidade Curricular "Segurança e Microbiologia Alimentar" na especialização em Bioquímica Alimentar.
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| Seminários de Bioquímica | BQ | 6 |
| › percurso: Bioquímica Alimentar |
| Bioquímica da Nutrição | BQ | 6 |
| Segurança e Qualidade Alimentar | BQ | 6 |
| Desenvolvimento de Novos Produtos Alimentares | BQ | 6 |
| › percurso: Bioquímica Clínica |
| Bioquímica Clínica Avançada | BQ | 6 |
| Patologia Clínica II | CBM | 6 |
| Diagnóstico Molecular | BQ | 6 |
| › percurso: Métodos Biomoleculares |
| Biologia do Genoma | B | 6 |
| Laboratórios de Bioquímica II | BQ | 6 |
| Microscopia e Ultraestrutura | B | 6 |
| Total de créditos ECTS: | 60 |
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| 2º ano › 1º semestre | a.c. | créditos ects |
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| Seminário | BQ | 12 |
| Dissertação/Projeto/Estágio | BQ | 18 |
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| 2º ano › 2º semestre | a.c. | créditos ects |
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| Dissertação/Projeto/Estágio | BQ | 30 |
| Total de créditos ECTS: | 60 |